古称淮水，据说秦始皇时凿通方山引淮水，横贯城中，故名秦淮河。
秦淮河分内河和外河，内河在南京城中，是十里秦淮最繁华之地。
南京在历史上曾经十一次定都，自古在内秦淮河人文苔革、商贾云集。六朝时代，夫子庙地区已相当繁华，乌衣巷、朱雀街、桃叶渡等处，都是当时高门大族所居。在明代，夫子庙作为国子监科举考场，考生云集，因此这里集中了许多服务行业，有各种酒楼、茶馆、小吃……。与此同时，青楼妓院也应运而生，内秦淮河上“浆声灯影连十里，歌女花船戏浊波”、“画船萧鼓，昼夜不绝”。古典戏剧《桃花扇》里所描写的“梨花似雪草如烟，春在秦淮两岸边，一带妆楼临水盖，家家粉影照蝉娟”十分真切地再现了当时秦淮河上的畸形繁华景象。
由于历史的变迁，昔日繁荣景象早已不复存在。1985年以后，江苏省、南京市拨出巨款对这一风光带进行修复，秦淮河又再度成为我国著名的游览胜地。经过修复的秦淮河风光带，以夫子庙为中心，秦淮河为纽带，包括瞻园、夫子庙、白暨洲、中华门，以及从桃叶渡至镇淮桥一带的秦淮水上游船和沿河楼阁景观，可谓集古迹、园林、画舫、市街、楼阁和民俗民风于一体的旅游线，极富情趣和魁力。