北洋海军提督署建于1887年，又称“水师衙门”，是北洋海军的指挥中心，当年北洋海军提督丁汝昌就在这里谋划指挥军事事宜。北洋海军提督署系清代砖木举架结构建筑，古朴典雅，稳重大方。整体建筑按中轴线建前、中、后三进院落，每进有中厅、东西侧厅和东西厢房。前、中、后院中厅分别为礼仪厅、议事厅、祭祀厅。各厅厢院落廊庑相接，雕梁画栋，结构严整。院内东南角有演武厅一座，其建筑融中西风格于一体，屋宇高阔，厅内宽广，内有挑檐式舞台一座。1891年，直隶总督兼北洋大臣李鸿章到威海巡阅北洋海军，曾在此处观礼，并在厅前检阅舰队操演。北洋海军提督署正面大门上方，悬挂李鸿章题“海军公所”匾额。两侧边门，分别绘有秦琼、敬德神像，描金点漆，肃穆威严。大门外东西两侧各置乐亭一座，为庆典、迎宾的鸣金奏乐之所。乐亭前面，建有东西辕门，样式恰似古典牌楼。门前广场对称竖立旗杆两支，青龙军旗迎风猎猎，颇壮军威。西辕门以西20米处，建二层了望楼一座，登楼远眺，港内舰船活动尽收眼底。