包拉温都自然保护区地处内蒙古草原和松辽平原的过渡地带，多为固定沙丘。耕地、沙丘、草原、碱地相间分布，垄状沙丘与垄间草原、碱地交错相间排列，呈西北一东南方向延伸，表 现为沙丘榆林、山杏林、草甸、芦苇、沼泽、湖泊水域的自然景观。该区属北温带大陆性气候，处于吉林省半干旱、半湿润草原气候地带。主要特点为:春季干旱多风，夏季湿热多雨，秋季凉爽多晴，冬季漫长严寒少雪，太阳辐射度高，日照丰富，雨热同步，有效降雨较多，对保护野生动植物、生物多样性，生息繁衍创造了有利条件。该区年平均气温5·1C，年平均降水量402.7mm，平均风速4·6米/秒。风沙土是该区分布最广的地带性土壤，其次是淡黑钙土、盐碱土、草甸土、沼泽土，土层厚度在0.5-1m之间，PH值在7.5-8.5之间。该区水资源总量为5023万立方米，其中:地表水为663万立方米，地下水为4360万立方米，区内的文牛格尺河为季节性河流，呈西北一东南贯穿全境。保护区自然资源丰富，其中有农田4705公顷，林业用地面积16522公顷(自有)，芦苇面积25017公顷，草原面积16840公顷，水面积500公顷，其它用地1394公顷。